Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl8cQ9D6I0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl8cQ9D6I0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl8cQ9D6I0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl8cQ9D6I0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl8cQ9D6I0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtl8cQ9D6I0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl8cQ9D6I0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl8cQ9D6I0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl8cQ9D6I0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl8cQ9D6I0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtl8cQ9D6I0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms