Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930449I24RikQ9D5E3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930449I24RikQ9D5E3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930449I24RikQ9D5E3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930449I24RikQ9D5E3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930449I24RikQ9D5E3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930449I24RikQ9D5E3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930449I24RikQ9D5E3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930449I24RikQ9D5E3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930449I24RikQ9D5E3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms