Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930556J24RikQ9D4U7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930556J24RikQ9D4U7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930556J24RikQ9D4U7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms