Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf6Q9D4J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf6Q9D4J7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf6Q9D4J7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf6Q9D4J7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf6Q9D4J7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf6Q9D4J7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf6Q9D4J7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf6Q9D4J7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf6Q9D4J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phf6Q9D4J7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phf6Q9D4J7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phf6Q9D4J7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phf6Q9D4J7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phf6Q9D4J7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.1 ms