Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a4cQ9D3F6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4cQ9D3F6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a4cQ9D3F6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4cQ9D3F6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a4cQ9D3F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4cQ9D3F6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4cQ9D3F6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4cQ9D3F6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4cQ9D3F6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms