Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc3Q9D2C9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc3Q9D2C9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc3Q9D2C9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snapc3Q9D2C9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snapc3Q9D2C9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snapc3Q9D2C9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc3Q9D2C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms