Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ss18l2Q9D174 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ss18l2Q9D174 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ss18l2Q9D174 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ss18l2Q9D174 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ss18l2Q9D174 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ss18l2Q9D174 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ss18l2Q9D174 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms