Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arv1Q9D0U9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arv1Q9D0U9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arv1Q9D0U9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arv1Q9D0U9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arv1Q9D0U9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arv1Q9D0U9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arv1Q9D0U9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms