Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F3

Lman1, Protein ERGIC-53, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman1Q9D0F3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Lman1Q9D0F3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lman1Q9D0F3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Lman1Q9D0F3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lman1Q9D0F3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Lman1Q9D0F3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Lman1Q9D0F3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Lman1Q9D0F3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Lman1Q9D0F3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Lman1Q9D0F3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Lman1Q9D0F3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Lman1Q9D0F3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Lman1Q9D0F3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Lman1Q9D0F3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,2 ms