Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbdc1Q9D0B6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pbdc1Q9D0B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbdc1Q9D0B6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbdc1Q9D0B6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbdc1Q9D0B6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pbdc1Q9D0B6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pbdc1Q9D0B6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbdc1Q9D0B6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms