Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrtapQ9CYD3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrtapQ9CYD3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrtapQ9CYD3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrtapQ9CYD3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrtapQ9CYD3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrtapQ9CYD3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CrtapQ9CYD3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrtapQ9CYD3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrtapQ9CYD3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms