Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmem39aQ9CYC3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem39aQ9CYC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmem39aQ9CYC3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmem39aQ9CYC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmem39aQ9CYC3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmem39aQ9CYC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem39aQ9CYC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem39aQ9CYC3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmem39aQ9CYC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmem39aQ9CYC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmem39aQ9CYC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmem39aQ9CYC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem39aQ9CYC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem39aQ9CYC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem39aQ9CYC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem39aQ9CYC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem39aQ9CYC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem39aQ9CYC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem39aQ9CYC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms