Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpl11Q9CXW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rpl11Q9CXW4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl11Q9CXW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl11Q9CXW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl11Q9CXW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl11Q9CXW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms