Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
RpainQ9CWY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
RpainQ9CWY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
RpainQ9CWY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
RpainQ9CWY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
RpainQ9CWY9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,97■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
RpainQ9CWY9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
RpainQ9CWY9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
RpainQ9CWY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
RpainQ9CWY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
RpainQ9CWY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
RpainQ9CWY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
RpainQ9CWY9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
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