Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Khdc3Q9CWU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Khdc3Q9CWU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Khdc3Q9CWU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Khdc3Q9CWU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Khdc3Q9CWU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Khdc3Q9CWU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Khdc3Q9CWU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Khdc3Q9CWU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms