Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tdrd12Q9CWU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd12Q9CWU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tdrd12Q9CWU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tdrd12Q9CWU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tdrd12Q9CWU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tdrd12Q9CWU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tdrd12Q9CWU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd12Q9CWU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd12Q9CWU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms