Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx28Q9CWT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx28Q9CWT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx28Q9CWT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx28Q9CWT6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx28Q9CWT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx28Q9CWT6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx28Q9CWT6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms