Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sppl3Q9CUS9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sppl3Q9CUS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sppl3Q9CUS9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sppl3Q9CUS9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sppl3Q9CUS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sppl3Q9CUS9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sppl3Q9CUS9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sppl3Q9CUS9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sppl3Q9CUS9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sppl3Q9CUS9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sppl3Q9CUS9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sppl3Q9CUS9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sppl3Q9CUS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sppl3Q9CUS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sppl3Q9CUS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sppl3Q9CUS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sppl3Q9CUS9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sppl3Q9CUS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sppl3Q9CUS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sppl3Q9CUS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sppl3Q9CUS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sppl3Q9CUS9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sppl3Q9CUS9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sppl3Q9CUS9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sppl3Q9CUS9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sppl3Q9CUS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sppl3Q9CUS9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sppl3Q9CUS9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms