Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc1aQ9CU62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smc1aQ9CU62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc1aQ9CU62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc1aQ9CU62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1aQ9CU62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smc1aQ9CU62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smc1aQ9CU62 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smc1aQ9CU62 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smc1aQ9CU62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smc1aQ9CU62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smc1aQ9CU62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smc1aQ9CU62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smc1aQ9CU62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms