Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ranbp3Q9CT10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ranbp3Q9CT10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ranbp3Q9CT10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ranbp3Q9CT10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ranbp3Q9CT10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ranbp3Q9CT10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ranbp3Q9CT10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ranbp3Q9CT10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ranbp3Q9CT10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms