Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR23

Tmem9, Transmembrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem9Q9CR23 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem9Q9CR23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem9Q9CR23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem9Q9CR23 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem9Q9CR23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem9Q9CR23 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem9Q9CR23 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem9Q9CR23 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem9Q9CR23 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem9Q9CR23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem9Q9CR23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem9Q9CR23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem9Q9CR23 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem9Q9CR23 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms