Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tm4sf20Q9CQY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm4sf20Q9CQY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm4sf20Q9CQY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm4sf20Q9CQY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm4sf20Q9CQY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tm4sf20Q9CQY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tm4sf20Q9CQY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms