Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg12Q9CQY1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg12Q9CQY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg12Q9CQY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg12Q9CQY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg12Q9CQY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg12Q9CQY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg12Q9CQY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg12Q9CQY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg12Q9CQY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms