Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV3

Serpinb11, Serpin B11, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb11Q9CQV3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb11Q9CQV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpinb11Q9CQV3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpinb11Q9CQV3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Serpinb11Q9CQV3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpinb11Q9CQV3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpinb11Q9CQV3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpinb11Q9CQV3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpinb11Q9CQV3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpinb11Q9CQV3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 711.4 ms