Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE2

Tmem223, Transmembrane protein 223, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem223Q9CQE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem223Q9CQE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem223Q9CQE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem223Q9CQE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem223Q9CQE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem223Q9CQE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem223Q9CQE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms