Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timm22Q9CQ85 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm22Q9CQ85 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Timm22Q9CQ85 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Timm22Q9CQ85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Timm22Q9CQ85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Timm22Q9CQ85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timm22Q9CQ85 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Timm22Q9CQ85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timm22Q9CQ85 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms