Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms