Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Commd4Q9CQ02 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Commd4Q9CQ02 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Commd4Q9CQ02 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Commd4Q9CQ02 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd4Q9CQ02 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd4Q9CQ02 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Commd4Q9CQ02 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms