Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ska1Q9CPV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska1Q9CPV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ska1Q9CPV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska1Q9CPV1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ska1Q9CPV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ska1Q9CPV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ska1Q9CPV1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska1Q9CPV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska1Q9CPV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ska1Q9CPV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms