Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930519G04RikQ9CPT7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930519G04RikQ9CPT7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930519G04RikQ9CPT7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms