Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dhx30Q99PU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dhx30Q99PU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dhx30Q99PU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dhx30Q99PU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dhx30Q99PU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx30Q99PU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dhx30Q99PU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx30Q99PU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Dhx30Q99PU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Dhx30Q99PU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Dhx30Q99PU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms