Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc24a3Q99PD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc24a3Q99PD7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc24a3Q99PD7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc24a3Q99PD7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc24a3Q99PD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc24a3Q99PD7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc24a3Q99PD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc24a3Q99PD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc24a3Q99PD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms