Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
CalcbQ99MP3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
CalcbQ99MP3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
CalcbQ99MP3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
CalcbQ99MP3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
CalcbQ99MP3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
CalcbQ99MP3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
CalcbQ99MP3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,19■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
CalcbQ99MP3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
CalcbQ99MP3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
CalcbQ99MP3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
CalcbQ99MP3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,93■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,9■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
CalcbQ99MP3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,85■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,89
CalcbQ99MP3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
CalcbQ99MP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
CalcbQ99MP3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
CalcbQ99MP3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms