Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca3Q99M54 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca3Q99M54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca3Q99M54 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdca3Q99M54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdca3Q99M54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdca3Q99M54 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdca3Q99M54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdca3Q99M54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms