Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp1b1Q99LU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp1b1Q99LU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp1b1Q99LU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp1b1Q99LU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp1b1Q99LU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp1b1Q99LU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp1b1Q99LU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms