Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 388.8 ms