Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcc1Q99LI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcc1Q99LI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcc1Q99LI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcc1Q99LI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcc1Q99LI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clcc1Q99LI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcc1Q99LI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcc1Q99LI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcc1Q99LI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms