Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf34Q99KR6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf34Q99KR6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf34Q99KR6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rnf34Q99KR6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf34Q99KR6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf34Q99KR6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf34Q99KR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf34Q99KR6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf34Q99KR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf34Q99KR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms