Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcf19Q99KJ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf19Q99KJ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf19Q99KJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcf19Q99KJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf19Q99KJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf19Q99KJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf19Q99KJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms