Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrbp1Q99J45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nrbp1Q99J45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nrbp1Q99J45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrbp1Q99J45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrbp1Q99J45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrbp1Q99J45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrbp1Q99J45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrbp1Q99J45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms