Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf144aQ925F3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf144aQ925F3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf144aQ925F3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf144aQ925F3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf144aQ925F3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf144aQ925F3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf144aQ925F3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf144aQ925F3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf144aQ925F3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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