Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo1Q924W9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo1Q924W9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo1Q924W9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo1Q924W9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmo1Q924W9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo1Q924W9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo1Q924W9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmo1Q924W9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmo1Q924W9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmo1Q924W9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmo1Q924W9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms