Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Alpk3Q924C5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Alpk3Q924C5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Alpk3Q924C5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Alpk3Q924C5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Alpk3Q924C5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Alpk3Q924C5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Alpk3Q924C5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Alpk3Q924C5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Alpk3Q924C5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Alpk3Q924C5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Alpk3Q924C5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Alpk3Q924C5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Alpk3Q924C5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Alpk3Q924C5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Alpk3Q924C5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Alpk3Q924C5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Alpk3Q924C5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Alpk3Q924C5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Alpk3Q924C5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Alpk3Q924C5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Alpk3Q924C5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Alpk3Q924C5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Alpk3Q924C5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Alpk3Q924C5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Alpk3Q924C5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Alpk3Q924C5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Alpk3Q924C5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Alpk3Q924C5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Alpk3Q924C5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Alpk3Q924C5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Alpk3Q924C5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Alpk3Q924C5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Alpk3Q924C5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Alpk3Q924C5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Alpk3Q924C5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Alpk3Q924C5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Alpk3Q924C5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Alpk3Q924C5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Alpk3Q924C5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Alpk3Q924C5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Alpk3Q924C5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Alpk3Q924C5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Alpk3Q924C5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Alpk3Q924C5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms