Protein–RNA interactions for Protein: Q91YV9

Tmem246, Transmembrane protein 246, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem246Q91YV9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem246Q91YV9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem246Q91YV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem246Q91YV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem246Q91YV9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem246Q91YV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem246Q91YV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem246Q91YV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem246Q91YV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem246Q91YV9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem246Q91YV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem246Q91YV9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem246Q91YV9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem246Q91YV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem246Q91YV9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem246Q91YV9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms