Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc49Q91YK0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc49Q91YK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc49Q91YK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc49Q91YK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc49Q91YK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc49Q91YK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc49Q91YK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms