Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx4Q91YJ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx4Q91YJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx4Q91YJ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx4Q91YJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx4Q91YJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx4Q91YJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx4Q91YJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms