Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec16bQ91XT4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec16bQ91XT4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec16bQ91XT4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec16bQ91XT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec16bQ91XT4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec16bQ91XT4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec16bQ91XT4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec16bQ91XT4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec16bQ91XT4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec16bQ91XT4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec16bQ91XT4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec16bQ91XT4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms