Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps11Q91W86 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps11Q91W86 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps11Q91W86 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps11Q91W86 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps11Q91W86 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps11Q91W86 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps11Q91W86 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps11Q91W86 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps11Q91W86 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps11Q91W86 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps11Q91W86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps11Q91W86 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms