Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN0

Lrp5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp5Q91VN0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrp5Q91VN0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrp5Q91VN0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrp5Q91VN0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrp5Q91VN0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrp5Q91VN0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrp5Q91VN0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrp5Q91VN0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrp5Q91VN0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrp5Q91VN0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrp5Q91VN0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrp5Q91VN0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrp5Q91VN0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrp5Q91VN0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Lrp5Q91VN0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrp5Q91VN0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrp5Q91VN0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrp5Q91VN0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrp5Q91VN0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrp5Q91VN0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Lrp5Q91VN0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lrp5Q91VN0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms