Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vsx1Q91V10 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vsx1Q91V10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vsx1Q91V10 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vsx1Q91V10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vsx1Q91V10 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vsx1Q91V10 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vsx1Q91V10 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vsx1Q91V10 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vsx1Q91V10 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vsx1Q91V10 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vsx1Q91V10 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vsx1Q91V10 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vsx1Q91V10 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsx1Q91V10 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vsx1Q91V10 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vsx1Q91V10 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vsx1Q91V10 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vsx1Q91V10 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vsx1Q91V10 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsx1Q91V10 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsx1Q91V10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vsx1Q91V10 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsx1Q91V10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsx1Q91V10 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsx1Q91V10 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsx1Q91V10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vsx1Q91V10 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms