Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Ppargc1bQ8VHJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Ppargc1bQ8VHJ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36,01■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35,95■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Ppargc1bQ8VHJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,77■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms